最近韓國與 2024 諾貝爾化學獎得主,華盛頓大學大衛‧貝克(David Baker)教授合作,用 AI 模仿病毒外殼蛋白結構,研發出能高效攜帶、運載核酸的藥物平台。除提升基因療法效率,也可望推動次世代疫苗及其他生物醫學創新。論文近日發表於國際知名科學期刊《自然》(Nature)。
病毒之所以迅速突變傳播,令人防不勝防,主要憑著蛋白外殼包裹 DNA、 RNA 等基因物質的獨特設計。先前有科學家嘗試模仿病毒蛋白外殼結構,幫助攜帶基因治療或疫苗 DNA,但遇到不少挑戰:如攜帶遺傳物質量有限,以及不具天然病毒功能性等。
為了克服限制,韓國浦項科技大學(Pohang University of Science & Technology)化學工程學系教授李相敏博士團隊,用人工智慧模擬新蛋白質外殼。李相敏 2021~2023 年在貝克教授實驗室從事博士後研究,這段經歷為此次合作奠定基礎。
雖然多數病毒外殼結構呈對稱性,但並非完美對稱而是些微不對稱。利用人工智慧,團隊創建微妙特徵,並首度成功設計四面體、八面體和 20 面體等人工蛋白「奈米籠」(nanocages)結構。直徑 75 奈米的 20 面體結構,基因承載量是傳統基因載體三倍,堪稱基因療法重要里程碑。
團隊進一步以電子顯微鏡檢驗新合成奈米籠外型,確認 AI 設計的奈米籠確實如預期形成對稱結構。也證實人工蛋白奈米結構能有效將治療性基因送至目標細胞,表明醫療應用的巨大潛力。李相敏表示:「AI 進步為設計及製造有功能的蛋白開創嶄新時代。希望我們研究不僅加速基因療法進化,也能推動疫苗及其他生物醫學創新。」
成功關鍵在 AI 應用,因 AI 能快速分析並模擬病毒蛋白奈米結構。團隊設計的奈米籠,共含四種人工蛋白,並六種蛋白─蛋白界面,結構高度複雜,若沒有高速運算的 AI 輔助,絕對無法達成。李相敏指出,將探索此平台用於癌症免疫治療及傳染病疫苗開發。
(首圖來源:Pixabay)