根據研究顯示，人體腸道菌相失衡與腸道疾病、代謝異常、免疫失調，甚至神經疾病皆有關聯，長庚醫院至今已完成 339 例腸道微菌叢植入治療（FMT），最新結合臨床與分子檢測技術，再推出台灣「腸道微菌叢全基因分析」技術，協助醫師預測腸炎、大腸癌、帕金森氏症等疾病風險。
美國 2022 年與 2023 年核准全球首批微生物治療藥物 Rebyota 與 Vowst，正式開啟「微生物藥物時代」，國科會積極布局推動「微生物相在精準健康之研發及應用計畫」，整合產學研醫能量，建構本土菌株資料庫並開發臨床應用。
長庚醫院自 2019 年起，已完成 339 例腸道微菌叢植入治療（FMT），針對難治型或反覆發作的困難梭菌感染（Clostridioides difficile infection，CDI）病患，單次 FMT 的臨床成功率高達 85.4%，顯著優於傳統抗生素治療僅約三成的成功率，且復發率更低。
長庚醫院透過重建腸道微生態，以 FMT 為高復發風險族群（如發炎性腸道疾病患者、長期使用免疫抑制藥物或抗生素者、年長者及癌症病患等）帶來新的治療契機，這次推出台灣「腸道微菌叢全基因分析」技術，可分析超過 14 萬種微生物與抗藥基因，開啟腸道精準醫療新時代。
林口長庚微菌治療中心主任李柏賢表示，「腸道微菌叢全基因分析」通過「實驗室自行開發檢測認證（Laboratory Developed Test，LDT）」，能一次解析 5,000~6,000 萬個基因片段，比對超過 14 萬種微生物與 6,400 筆抗藥性基因資料庫，為每個人建立專屬的「腸道健康地圖」。
李柏賢指出，腸道菌相的「多樣性」是健康的關鍵指標之一，當菌種多樣性下降時，往往代表腸道微生態失衡，根據研究可能與肥胖、糖尿病、發炎性腸道疾病、憂鬱症等多種慢性疾病風險上升有關，因此即早掌握腸道失衡的警訊，進行風險預防與營養調整，有助於擬定個人化健康管理策略。
李柏賢分享，一名罹患潰瘍性結腸炎的年輕女性，兩年來飽受劇烈腹痛、頻繁腹瀉與血便困擾，對多種藥物皆無明顯改善，被迫留職停薪、長期困在家中，生活陷入低谷，臨床團隊起初懷疑是合併困難梭菌感染，但多次檢驗結果均呈陰性，診斷一度陷入僵局。
李柏賢說明，檢驗醫學部團隊突破傳統診斷框架，利用先進質譜儀（MALDI-TOF MS）技術，比對超過 9,000 筆蛋白質圖譜，最終鎖定真正的致病元凶「無毒梭菌（Clostridium innocuum）」，經過針對性抗生素治療後，患者的腹痛與腹瀉完全解除，症狀不再復發，腸黏膜已完全癒合。
林口長庚醫院檢驗醫學部部主任黃瓊瑰表示，透過精準鑑定，幫助醫師迅速分辨 CI 與 CDI，讓隱形的壞菌無所遁形，並確保病人不會因為錯誤用藥而延誤治療，這項成果不僅改善臨床治療決策，也奠定台灣在腸道病原菌快速鑑定領域的國際地位。
林口長庚副院長邱政洵表示，腸道是人體的「第二基因組」，影響免疫、代謝與心理健康，這次透過微菌叢治療與基因檢測的結合，長庚醫院正實現精準醫療在腸道領域的願景，為病患帶來重生契機，更為全民健康開啟新篇章。
（首圖來源：長庚醫院）
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