
細胞 DNA 並非所有都有明顯功能,或為維持生命正常運作存在。有些片段就像「搭便車」投機客,不為生物個體帶來明顯益處,卻「自私地」悄悄繁衍。最近美國加州大學廣泛分析「introners」DNA 片段,揭示不僅基因自我複製,還可跨越物種傳播。論文刊登於《美國國家科學院院刊》(PNAS),為理解基因體演化與複雜性的起源提供全新視角。
介紹 introners 前,先複習 intron(內含子)概念。Intron 是基因中不參與蛋白質編碼的 DNA 片段,製造蛋白質前,mRNA 的 intron 會剪接去除(splice out),只留下 exon(外顯子)編碼以合成蛋白質。
Intron 讓基因表現更有彈性,如透過「選擇性剪接」(alternative splicing)機制,單一基因可產生多種功能蛋白質。這是多細胞生物能發展出複雜構造的原因之一,但也伴隨風險,若剪接出錯,可能導致疾病。然而 intron 演化起源為何?至今仍未有定論。
Introners 是什麼?
為了釐清 intron 從何而來,團隊焦點放在 introners 的 DNA 元件。Introners 是「跳躍基因」(transposable element),能在基因體內轉移插隊,甚至自行複製。更特別的是,它們攜帶 intron 片段,也就是說 intron 可能源自 introners!
更有趣的是,introners 本身攜帶的 intron 序列,不僅能成功插入宿主基因組,還能被細胞剪接機制辨識並正確剪接,就像原就屬於基因的 intron。這意味 introners 可能直接參與新 intron 形成。
Introners 物種分布廣泛
團隊分析了來自 8,716 個物種的基因體資料,涵蓋單細胞原生生物到海膽、藻類、真菌等。他們總共辨識出多達 1,093 個 introners 家族,顯示其分布之廣泛,影響深遠。研究團隊還證明 introners 曾經跨越物種藩籬,完成「水平基因轉移」。這是人類首次實證發現攜帶 intron 的 DNA 元素,能在物種間跳躍,促進新的 intron 之產生。
引人注目例證之一是,introners 曾從海綿轉移至甲藻 (dinoflagellate)。這次轉移大約發生在 4,000 萬年前,科學家推測可能是透過「巨型病毒」的幫助完成的。這種「寄生客利用寄生病毒」完成跨物種跳躍,可謂基因界的無間道。此研究資深科學家,羅素‧柯貝特─迪蒂格(Russ Corbett-Detig)教授指出:「introners 並不是為了幫助生物生存演化的 DNA 片段,而是靠著『搭便車與插隊』留下來的『投機分子 DNA 』。」
這項研究顛覆了我們對基因體演化的認知,指出基因複雜性不只是自然選擇的結果,也可能來自 introners──這些跳躍、複製、甚至能跨物種傳播的「DNA 投機客」。它們恣意插入 intron 的過程,可能意外豐富基因調控與多樣性,也讓我們意識到:演化,從來不是單行道。
(首圖來源:Unsplash)