以 NGS 技術為基礎的伴隨式診斷,奠定 NGS 臨床法規監管明確化

作者 | 發布日期 2018 年 09 月 25 日 16:19 | 分類 生物科技 , 醫療科技 follow us in feedly

2018 年 8 月 CFDA 通過兩項以次世代定序(Next Generation Sequencing,NGS)為技術基礎的伴隨式診斷產品,分別由廣州燃石醫學檢驗公司及北京諾禾致源科技公司獲得,這兩個通過審核的產品,也促使中國跟隨美國步伐,將 NGS 法規監管明確化,以規範、鼓勵、推進 NGS 技術於臨床應用。



伴隨式診斷在癌症臨床應用存在已久,是一種用於輔助醫師做出特定藥品處方決策的檢驗方法,此法可藉由分析病患帶有的特定生物標記(Biomarker or Gene),預測某類藥物對該病患是否有效與安全。

▲ CFDA 最新通過審批之基於 NGS 技術的伴隨性診斷產品。(Source:拓墣產業研究院整理,2018.9)

過去 FDA 核准的伴隨式診斷產品,大多是單一生物標記對應單一疾病的藥物處方決策,例如 HER2 與 Herceptin、EGFR 與 Iressa 等。然而利用 NGS 技術進行全基因定序,能一次性掃描多個甚至百個基因,範圍遍及整個基因體,同時也能對應多個疾病與多種藥物,例如 Foundation One CDx 同時對應 5 種癌症及 17 種癌症標靶藥物。

此種以 NGS 技術為基礎的伴隨式診斷,在定序完成後所得的序列資料仍需進一步運用生物資訊分析技術,進行序列重組、比對、分析,以找出序列資料中基因突變的片段,方能更精確判斷造成細胞癌化的突變基因組合(Gene Panel,非單一基因),再將突變組合與資料庫進行比對,找出最適合受檢病患的治療藥物。

上述從 NGS 定序至基因體序列分析,再到資料庫比對,整個流程完備才是以 NGS 技術為基礎的伴隨式診斷流程;流程包含定序實驗室與後段的數據分析兩大部分,兩者都需要品質管控的標準與規範存在,這也奠定以 NGS 技術為基礎的伴隨式診斷產品,始能為臨床醫療應用提供穩定且嚴謹的精準醫療用藥決策。

▲ NGS 技術支持的癌症相關生物標記在臨床應用的分級。(Source:拓墣產業研究院整理,2018.9)

NGS 技術目前已被廣泛應用在臨床檢測,伴隨性診斷是目前臨床驗證最嚴謹的 NGS 技術應用。由上圖例子可看出,僅有經過臨床科學驗證的疾病相關突變基因,才有臨床上的意義,也才能進行臨床試驗驗證,成為伴隨式診斷標的,在如此嚴謹的科學驗證後,才能作為臨床醫師重要的用藥建議。

隨著 NGS 伴隨式診斷產品陸續獲得美國 FDA 及 CFDA 許可,意味 NGS 基因檢測產業有新的商業模式突破點,藉由與臨床診斷緊密相關優勢,除了能提供醫生更精準的藥物決策資訊外,又能建立合理的醫療保險給付機制,擴大使用族群;在累積大量基因數據後,更能增加與國際藥廠合作、進行新藥開發的機會。

台灣進行癌症基因突變組合的臨床研究與開發,主要以教學醫院為臨床研究核心,其中又以台灣大學醫學院、台北醫學大學、長庚醫學大學及中國醫藥大學最積極,針對此領域投入研發的台灣廠商主要有:行動基因、慧智基因、麗寶生醫、威健生技、有勁生技,其中行動基因近期不僅與臨床醫療單位合作,更積極與國際藥廠接觸、合作。

台灣臨床環境建全、醫療資料豐富且分子診斷人才充足,實是針對 NGS 臨床應用產品開發與驗證的好地點,然而明確的法規,例如醫療器材上市審核、實驗室規範及病歷資料使用辦法,以及保險給付條件的確立等,各項與臨床醫療服務相關的重要法規,都是推進 NGS 臨床醫療檢測產業發展最重要關鍵因素,期待衛福部於 2018 年提出的管理辦法,能促進台灣基因檢測產業發展。

(首圖來源:shutterstock)